IEs4Linux es software libre, contemplado por la GPL. Pero IE es propietario, con copyright y tienes que aceptar su licencia.

Toma nota de que para instalar cualquier programa de Microsoft incluso sobre IEs4Linux, necesitas una licencia válida de Windows. IEs4Linux no te la va a pedir y puedes ejecutar todo sin problemas aún sin tener una licencia. Pero eso es ilegal y yo no tengo nada que ver con ello.

Y además debes aceptar la licencia de Adobe Flash.

[edit] Explicación más detallada

La licencia de MS IE reza:

NOTE:  IF YOU DO NOT HAVE A VALID EULA FOR ANY "OS PRODUCT" (MICROSOFT WINDOWS 
95, MICROSOFT WINDOWS 98, MICROSOFT WINDOWS NT WORKSTATION 4.0, MICROSOFT 
WINDOWS NT SERVER 4.0, MICROSOFT WINDOWS NT SERVER, ENTERPRISE EDITION 4.0 OR 
MICROSOFT WINDOWS NT SERVER 4.0, TERMINAL SERVER EDITION), YOU ARE NOT 
AUTHORIZED TO INSTALL, COPY, OR OTHERWISE USE THE OS COMPONENTS AND YOU HAVE 
NO RIGHTS UNDER THIS SUPPLEMENTAL EULA.

Esto es: debes poseer una licencia de SO válida (cualquier versión de Windows posterior a 95). Pero este EULA no dice que tengas que instalarlo sobre Windows. Entonces, necesitas una licencia válida de Windows, pero lo puedes instalar sobre Linux.

IEs4Linux no puede saber si posees o no dicha licencia de Windows. Este software es provisto solo para gente que posee su licencia. Si usas IEs4Linux sin poseer una licencia de Windows, estarás fuera de la ley.